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*変数を 20 個以上 TABLE に出力したい
PRED-defined の変数が多数ある時、$TABLE ですべての変数を出力したくても NONMEM V では 20 個までしか出力できない(VI では 50 個まで)。$TABLE を複数用意して、別々の TABLE に出力させようとしてもエラーが出る。
以下のように、$PROBLEM を複数に分ければよい。
-1 回目の run ($PROBLEM 1) での結果を $EST MSF= で出力しておく。
-2 回目の run ($PROBLEM 2) ではその結果を $MSFI で読み込み、推定は実行しない。ただ単に $TABLE 出力のみを行わせる。
$PROBLEM 1(ESTIMATION)
$DATA DATA.TXT
$INPUT ID TIME AMT DV
$SUB ADVAN1 TRANS2
$PK
CL=THETA(1)*EXP(ETA(1))
V =THETA(2)*EXP(ETA(2))
;
SC=V/1000
;
; 以下、適当
X1=1
X2=2
X3=3
X4=4
X5=5
X6=6
X7=7
X8=8
X9=9
X10=10
X11=1
X12=2
X13=3
X14=4
X15=5
X16=6
X17=7
X18=8
X19=9
X20=10
X21=11
;
$ERROR
Y=F*EXP(ERR(1))
$THETA
(0 0.1)
(0 1)
$OMEGA 0.04 0.04
$SIGMA 0.01
$EST MAXE=9999 MSF=MSF1.DAT
$COV
$TABLE
NOPRINT ONEHEADER NOAPPEND FILE=TAB1.TXT
X1 X2 X3 X4 X5 X6 X7 X8 X9 X10
X11 X12 X13 X14 X15 X16 X17 X18 X19 X20
;X21 ; 21 個目を出力しようとするとエラーが出る
;
$PROBLEM 2
$DATA DATA.TXT REWIND
$INPUT ID TIME AMT DV
$MSFI MSF1.DAT ; PROBLEM 1 での推定結果をそのまま用いる
$TABLE
NOPRINT ONEHEADER NOAPPEND FILE=TAB2.TXT
X21
;
----
参照:
-[NMusers] Too many PRED-generated items in $TABLE (Mar, 2008)
*変数を 20 個以上 TABLE に出力したい
PRED-defined の変数が多数ある時、$TABLE ですべての変数を出力したくても NONMEM V では 20 個までしか出力できない(VI では 50 個まで)。$TABLE を複数用意して、別々の TABLE に出力させようとしてもエラーが出る。
以下のように、$PROBLEM を複数に分ければよい。
-1 回目の run ($PROBLEM 1) での結果を $EST MSF= で出力しておく。
-2 回目の run ($PROBLEM 2) ではその結果を $MSFI で読み込み、推定は実行しない。ただ単に $TABLE 出力のみを行わせる。
$PROBLEM 1(ESTIMATION)
$DATA DATA.TXT
$INPUT ID TIME AMT DV
$SUB ADVAN1 TRANS2
$PK
CL=THETA(1)*EXP(ETA(1))
V =THETA(2)*EXP(ETA(2))
;
SC=V
;
; 以下、適当
X1=1
X2=2
X3=3
X4=4
X5=5
X6=6
X7=7
X8=8
X9=9
X10=10
X11=1
X12=2
X13=3
X14=4
X15=5
X16=6
X17=7
X18=8
X19=9
X20=10
X21=11
;
$ERROR
Y=F*EXP(ERR(1))
$THETA
(0 0.1)
(0 1)
$OMEGA 0.04 0.04
$SIGMA 0.01
$EST MAXE=9999 MSF=MSF1.DAT
$COV
$TABLE
NOPRINT ONEHEADER NOAPPEND FILE=TAB1.TXT
X1 X2 X3 X4 X5 X6 X7 X8 X9 X10
X11 X12 X13 X14 X15 X16 X17 X18 X19 X20
;X21 ; 21 個目を出力しようとするとエラーが出る
;
$PROBLEM 2
$DATA DATA.TXT REWIND
$INPUT ID TIME AMT DV
$MSFI MSF1.DAT ; PROBLEM 1 での推定結果をそのまま用いる
$TABLE
NOPRINT ONEHEADER NOAPPEND FILE=TAB2.TXT
X21
;
----
参照:
-[NMusers] Too many PRED-generated items in $TABLE (Mar, 2008)
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